O Clã Kaguya era um clã muito poderoso no País da Água, por causa de sua Kekkei Genkai. Sempre que começava uma guerra era utilizados, o que fez seus membros ganharem um certo prazer nas lutas. Viraram um clã militar, com interesse apenas na guerra. Se deliciaram com as batalhas da Terceira Guerra Secreta. Quando ela acabou, os membros desse clã queriam mais, e pensaram em atacar Kirigakure no Sato.

Juntaram todos e invadiram. Foram massacrados. Somente o jovem Kaguya Kimimaro sobreviveu. Sua Kekkei Genkai, Shikotsu Myaku (Passagem dos Ossos do Corpo), permite que o ninja controle livremente os ossos de seu corpo. Ele pode retirar o osso de seu braço e utilizá-lo como arma ou um escudo, ou ainda os dois simultaneamente; atirar pedaços dos ossos para atacar o oponente.

Tudo isso somado à rápida recuperação dos ossos faz com que o ninja ataque e se defenda ao mesmo tempo. Normalmente, a limitação desse controle varia de pessoa para pessoa, alguns nascendo com mais controle do que os outros. Mesmo assim, essa Kekkei Genkai traz limitações: pela complexidade do corpo do usuário, raramente um tratamento normal fará resultado. E ainda tem a possibilidade de uma doença rara aparecer nessa pessoa, o que significa a morte dela.

As técnicas próprias dessa Kekkei Genkai, logo, únicas desse clã, são: Karamatsu no Mai, Sawarabi no Mai, Teshi Sendan, Tessenka no Mai, Tsubaki no Mai, Yanagi no Mai.